MB熒光定量PCR檢測試劑盒(如Venor®Gem qEP)的使用方法如下:
實驗前準備
試劑準備:確認試劑盒完整性,包括反應(yīng)液、引物、探針、陽性對照、陰性對照等。將試劑從冰箱中取出,在2~8℃下平衡至室溫。干粉溶解后,試劑應(yīng)保存在<-18℃的環(huán)境中,避免反復(fù)凍融。溶解后的內(nèi)控對照和陽性對照應(yīng)分裝保存。
設(shè)備準備:檢查熒光定量PCR儀、離心機等設(shè)備狀態(tài),確保正常運行。準備冰盒,用于存放需要低溫操作的試劑。
樣本準備:根據(jù)實驗?zāi)康倪x擇合適的樣本類型,如細胞培養(yǎng)物、組織樣本等。樣本處理應(yīng)遵循無菌操作原則,避免污染。
反應(yīng)體系配置
預(yù)混液配制:根據(jù)樣本數(shù)量,計算所需預(yù)混液的體積。在室溫下,將反應(yīng)液、引物、探針等組分在1.5ml反應(yīng)管中混合均勻。預(yù)混液應(yīng)用移液器吹打混勻(約5次)。
分裝預(yù)混液:每個PCR管中加入適量預(yù)混液(如15μl或23μl,具體根據(jù)實驗要求而定),棄掉剩余液體。
加入模板:在每個PCR管中分別加入陰性對照、陽性對照和樣本模板,每管加入的模板體積應(yīng)一致(如2μl)。建立陰性(無模板控制,NTC)和陽性控制。
PCR擴增
上機操作:將配置好的PCR管放入熒光定量PCR儀中,按照儀器操作說明設(shè)置反應(yīng)程序。
反應(yīng)程序設(shè)置:
預(yù)變性:95℃下預(yù)變性2-5分鐘,使DNA雙鏈解開。
循環(huán)擴增:通常包括變性、退火、延伸三個步驟。例如,95℃下變性15秒,60℃下退火30秒,72℃下延伸30秒,共進行30-40個循環(huán)。具體溫度和時間可根據(jù)實驗要求進行調(diào)整。
熔解曲線分析(可選):在PCR擴增結(jié)束后,進行熔解曲線分析,以確認擴增產(chǎn)物的特異性。
結(jié)果分析
數(shù)據(jù)收集:PCR儀在每個循環(huán)的延伸階段或熔解曲線階段收集熒光信號,形成擴增曲線。
結(jié)果判定:
陽性結(jié)果:檢測通道Ct值≤40,且曲線有明顯的指數(shù)增長曲線。
陰性結(jié)果:樣本檢測結(jié)果無Ct值,且無特異性擴增曲線。
可疑結(jié)果:樣本檢測結(jié)果40
質(zhì)控標準:
陰性對照:無特異性擴增曲線或無Ct值顯示。
陽性對照:擴增曲線有明顯指數(shù)增長期,且Ct值≤32。
MB熒光定量PCR檢測試劑盒注意事項:
避免污染:PCR實驗對污染非常敏感,應(yīng)嚴格遵守無菌操作原則。所有操作應(yīng)在不同的實驗區(qū)域進行,如樣本處理區(qū)、試劑準備區(qū)、PCR擴增區(qū)等。使用一次性吸頭、手套和工作服,避免交叉污染。
溫度控制:Taq DNA聚合酶對溫度非常敏感,應(yīng)確保PCR儀準確無誤地執(zhí)行設(shè)定程序。試劑在使用前應(yīng)充分融化并混勻,避免溫度波動影響反應(yīng)效率。
試劑保存:不同成分的最佳儲存條件有所差異,請嚴格按照說明書要求存放試劑。避免將試劑直接放在室溫下解凍,以免溫度波動影響酶的活性。
操作細節(jié):加樣時應(yīng)準確、迅速,避免產(chǎn)生氣泡?;靹蛟噭r應(yīng)避免劇烈震蕩或渦旋混勻,以免破壞酶的活性。上機前應(yīng)仔細檢查管子,確保管蓋、管身無記號筆染料,管內(nèi)無氣泡、管壁無液體。